Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.47
H2-Ab1P01921 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
H2-Ab1P01921 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms