Protein–RNA interactions for Protein: P01791

Ig heavy chain V region HPCM6, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01791 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01791 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01791 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01791 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01791 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01791 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01791 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01791 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01791 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01791 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01791 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01791 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01791 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01791 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01791 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01791 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01791 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01791 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01791 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01791 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01791 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01791 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01791 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01791 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01791 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01791 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01791 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01791 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01791 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01791 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01791 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01791 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01791 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01791 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01791 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01791 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01791 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01791 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01791 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01791 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01791 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01791 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01791 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01791 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01791 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01791 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01791 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01791 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01791 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01791 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01791 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01791 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01791 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01791 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01791 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01791 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01791 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01791 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01791 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01791 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01791 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01791 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01791 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01791 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01791 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01791 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01791 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01791 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01791 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01791 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01791 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01791 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01791 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01791 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01791 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01791 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01791 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01791 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01791 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01791 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01791 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01791 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01791 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01791 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01791 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01791 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
P01791 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
P01791 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01791 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01791 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01791 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01791 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01791 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01791 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01791 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01791 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01791 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01791 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01791 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01791 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms