Protein–RNA interactions for Protein: P01757

Ig heavy chain V region J558, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01757 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01757 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01757 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01757 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01757 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P01757 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01757 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01757 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01757 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01757 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01757 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01757 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01757 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01757 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01757 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01757 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01757 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01757 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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P01757 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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P01757 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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P01757 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01757 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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P01757 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01757 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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P01757 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01757 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01757 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01757 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01757 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01757 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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P01757 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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P01757 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01757 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01757 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01757 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01757 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01757 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01757 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01757 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01757 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01757 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01757 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01757 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01757 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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P01757 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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P01757 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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P01757 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01757 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01757 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01757 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01757 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01757 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01757 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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P01757 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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P01757 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01757 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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P01757 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01757 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01757 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01757 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01757 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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