Protein–RNA interactions for Protein: P01747

Ig heavy chain V region 36-65, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01747 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01747 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01747 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01747 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01747 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01747 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01747 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01747 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01747 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01747 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01747 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01747 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01747 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01747 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01747 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01747 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01747 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01747 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01747 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01747 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01747 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01747 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01747 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01747 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01747 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01747 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01747 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01747 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01747 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01747 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01747 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01747 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01747 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01747 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01747 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01747 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01747 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01747 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01747 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01747 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01747 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01747 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01747 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01747 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01747 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01747 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01747 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01747 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01747 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01747 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01747 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01747 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01747 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01747 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01747 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01747 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01747 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01747 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01747 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01747 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01747 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01747 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01747 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01747 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01747 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01747 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01747 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01747 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01747 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01747 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01747 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01747 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01747 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01747 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01747 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01747 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01747 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01747 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01747 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01747 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01747 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01747 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01747 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01747 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01747 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01747 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
P01747 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01747 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01747 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01747 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01747 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01747 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01747 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01747 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01747 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01747 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01747 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01747 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01747 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01747 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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