Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl20O89093 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
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