Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp1O89090 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sp1O89090 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sp1O89090 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sp1O89090 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sp1O89090 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sp1O89090 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sp1O89090 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sp1O89090 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sp1O89090 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sp1O89090 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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