Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CopeO89079 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CopeO89079 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CopeO89079 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CopeO89079 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CopeO89079 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CopeO89079 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CopeO89079 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CopeO89079 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CopeO89079 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CopeO89079 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CopeO89079 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CopeO89079 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CopeO89079 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CopeO89079 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CopeO89079 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CopeO89079 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CopeO89079 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CopeO89079 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CopeO89079 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CopeO89079 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CopeO89079 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CopeO89079 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CopeO89079 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CopeO89079 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CopeO89079 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CopeO89079 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CopeO89079 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CopeO89079 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CopeO89079 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CopeO89079 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CopeO89079 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CopeO89079 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CopeO89079 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CopeO89079 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CopeO89079 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CopeO89079 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CopeO89079 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CopeO89079 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CopeO89079 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CopeO89079 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CopeO89079 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CopeO89079 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CopeO89079 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CopeO89079 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CopeO89079 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CopeO89079 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CopeO89079 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CopeO89079 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CopeO89079 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CopeO89079 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CopeO89079 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CopeO89079 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CopeO89079 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CopeO89079 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CopeO89079 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CopeO89079 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CopeO89079 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CopeO89079 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CopeO89079 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CopeO89079 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CopeO89079 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CopeO89079 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CopeO89079 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CopeO89079 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CopeO89079 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CopeO89079 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CopeO89079 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CopeO89079 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CopeO89079 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CopeO89079 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CopeO89079 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CopeO89079 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CopeO89079 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CopeO89079 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CopeO89079 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CopeO89079 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CopeO89079 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CopeO89079 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CopeO89079 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CopeO89079 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CopeO89079 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CopeO89079 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CopeO89079 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CopeO89079 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CopeO89079 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CopeO89079 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CopeO89079 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CopeO89079 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CopeO89079 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CopeO89079 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CopeO89079 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CopeO89079 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CopeO89079 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CopeO89079 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CopeO89079 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CopeO89079 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CopeO89079 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CopeO89079 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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