Protein–RNA interactions for Protein: O88609

Lmx1b, LIM homeobox transcription factor 1-beta, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1bO88609 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Lmx1bO88609 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmx1bO88609 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmx1bO88609 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmx1bO88609 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmx1bO88609 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmx1bO88609 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmx1bO88609 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmx1bO88609 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmx1bO88609 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmx1bO88609 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmx1bO88609 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Lmx1bO88609 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmx1bO88609 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmx1bO88609 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmx1bO88609 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lmx1bO88609 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmx1bO88609 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmx1bO88609 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmx1bO88609 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmx1bO88609 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmx1bO88609 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmx1bO88609 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmx1bO88609 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmx1bO88609 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmx1bO88609 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmx1bO88609 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Lmx1bO88609 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Lmx1bO88609 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lmx1bO88609 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Lmx1bO88609 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Lmx1bO88609 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Lmx1bO88609 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Lmx1bO88609 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Lmx1bO88609 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmx1bO88609 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmx1bO88609 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmx1bO88609 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmx1bO88609 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmx1bO88609 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmx1bO88609 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmx1bO88609 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmx1bO88609 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmx1bO88609 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmx1bO88609 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmx1bO88609 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmx1bO88609 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmx1bO88609 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmx1bO88609 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmx1bO88609 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmx1bO88609 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmx1bO88609 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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