Protein–RNA interactions for Protein: O88520

Shoc2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shoc2O88520 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shoc2O88520 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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