Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnmt3aO88508 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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