Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Stra6O70491 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stra6O70491 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stra6O70491 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stra6O70491 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stra6O70491 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Stra6O70491 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stra6O70491 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.6 ms