Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms