Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copb2O55029 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copb2O55029 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Copb2O55029 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copb2O55029 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copb2O55029 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copb2O55029 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Copb2O55029 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copb2O55029 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Copb2O55029 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copb2O55029 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Copb2O55029 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Copb2O55029 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copb2O55029 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms