Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BckdkO55028 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
BckdkO55028 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BckdkO55028 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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BckdkO55028 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
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