Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Cldn5O54942 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Cldn5O54942 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Cldn5O54942 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Cldn5O54942 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Cldn5O54942 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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