Protein–RNA interactions for Protein: O54891

Lgals6, Galectin-6, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgals6O54891 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lgals6O54891 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms