Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms