Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChkaO54804 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChkaO54804 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChkaO54804 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChkaO54804 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChkaO54804 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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