Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited2O35740 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited2O35740 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited2O35740 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited2O35740 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited2O35740 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited2O35740 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited2O35740 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited2O35740 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited2O35740 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cited2O35740 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cited2O35740 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cited2O35740 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cited2O35740 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cited2O35740 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms