Protein–RNA interactions for Protein: O35595

Ptch2, Protein patched homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptch2O35595 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ptch2O35595 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptch2O35595 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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