Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TnxbO35452 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TnxbO35452 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gstm2-202ENSMUST00000066530 854 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TnxbO35452 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TnxbO35452 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TnxbO35452 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TnxbO35452 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TnxbO35452 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TnxbO35452 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TnxbO35452 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms