Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Slc18a3O35304 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms