Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hps1O08983 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hps1O08983 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hps1O08983 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps1O08983 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps1O08983 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps1O08983 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps1O08983 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hps1O08983 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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