Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

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Length 602 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
EllO08856 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
EllO08856 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
EllO08856 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
EllO08856 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
EllO08856 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
EllO08856 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
EllO08856 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
EllO08856 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
EllO08856 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
EllO08856 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
EllO08856 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
EllO08856 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
EllO08856 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
EllO08856 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
EllO08856 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
EllO08856 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
EllO08856 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
EllO08856 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
EllO08856 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
EllO08856 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
EllO08856 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
EllO08856 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
EllO08856 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
EllO08856 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
EllO08856 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
EllO08856 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
EllO08856 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
EllO08856 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
EllO08856 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
EllO08856 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
EllO08856 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
EllO08856 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
EllO08856 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
EllO08856 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
EllO08856 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
EllO08856 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
EllO08856 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
EllO08856 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
EllO08856 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
EllO08856 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
EllO08856 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
EllO08856 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
EllO08856 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
EllO08856 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
EllO08856 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
EllO08856 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
EllO08856 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
EllO08856 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
EllO08856 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
EllO08856 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
EllO08856 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
EllO08856 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
EllO08856 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
EllO08856 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
EllO08856 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
EllO08856 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
EllO08856 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
EllO08856 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
EllO08856 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
EllO08856 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
EllO08856 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
EllO08856 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
EllO08856 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
EllO08856 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
EllO08856 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
EllO08856 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
EllO08856 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
EllO08856 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
EllO08856 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
EllO08856 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
EllO08856 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
EllO08856 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
EllO08856 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
EllO08856 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
EllO08856 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
EllO08856 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
EllO08856 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
EllO08856 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
EllO08856 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
EllO08856 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
EllO08856 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
EllO08856 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
EllO08856 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
EllO08856 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
EllO08856 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
EllO08856 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
EllO08856 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
EllO08856 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
EllO08856 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
EllO08856 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
EllO08856 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
EllO08856 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
EllO08856 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
EllO08856 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
EllO08856 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
EllO08856 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
EllO08856 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
EllO08856 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
EllO08856 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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