Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eftud2O08810 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms