Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms