Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Gm20939L7N243 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Gm20939L7N243 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Gm20939L7N243 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Gm20939L7N243 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Gm20939L7N243 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Gm20939L7N243 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20939L7N243 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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