Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21310J3QQ23 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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