Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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