Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Cldn34c3J3QJW5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Cldn34c3J3QJW5 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn34c3J3QJW5 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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