Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21818J3KMS6 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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