Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp408H7BX78 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms