Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G2

Usp17ld, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein D, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17ldG5E8G2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp17ldG5E8G2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp17ldG5E8G2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms