Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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