Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM2

Ccl26, Chemokine (C-C motif) ligand 26, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl26F8VQM2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl26F8VQM2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms