Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5160F8VPN3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5160F8VPN3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5160F8VPN3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5160F8VPN3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5160F8VPN3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5160F8VPN3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5160F8VPN3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5160F8VPN3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5160F8VPN3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5160F8VPN3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5160F8VPN3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm5160F8VPN3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm5160F8VPN3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm5160F8VPN3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm5160F8VPN3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm5160F8VPN3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm5160F8VPN3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5160F8VPN3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms