Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms