Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms