Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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