Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Gm10378F6XQQ1 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Gm10378F6XQQ1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Gm10378F6XQQ1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Gm10378F6XQQ1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Gm10378F6XQQ1 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Gm10378F6XQQ1 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Gm10378F6XQQ1 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Gm10378F6XQQ1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Gm10378F6XQQ1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Gm10378F6XQQ1 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Gm10378F6XQQ1 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm10378F6XQQ1 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Gm10378F6XQQ1 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms