Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Crocc2F6XLV1 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Crocc2F6XLV1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Crocc2F6XLV1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Crocc2F6XLV1 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Crocc2F6XLV1 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Crocc2F6XLV1 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Crocc2F6XLV1 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Crocc2F6XLV1 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Crocc2F6XLV1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Crocc2F6XLV1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Crocc2F6XLV1 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Crocc2F6XLV1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Crocc2F6XLV1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Crocc2F6XLV1 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Crocc2F6XLV1 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Crocc2F6XLV1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Crocc2F6XLV1 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Crocc2F6XLV1 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Crocc2F6XLV1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Crocc2F6XLV1 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Crocc2F6XLV1 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Crocc2F6XLV1 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Crocc2F6XLV1 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Crocc2F6XLV1 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Crocc2F6XLV1 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Crocc2F6XLV1 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Crocc2F6XLV1 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Crocc2F6XLV1 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Crocc2F6XLV1 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Crocc2F6XLV1 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Crocc2F6XLV1 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Crocc2F6XLV1 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Crocc2F6XLV1 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Crocc2F6XLV1 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Crocc2F6XLV1 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Crocc2F6XLV1 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Crocc2F6XLV1 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Crocc2F6XLV1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Crocc2F6XLV1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Crocc2F6XLV1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Crocc2F6XLV1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Crocc2F6XLV1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Crocc2F6XLV1 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Crocc2F6XLV1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Crocc2F6XLV1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Crocc2F6XLV1 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Crocc2F6XLV1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Crocc2F6XLV1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Crocc2F6XLV1 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Crocc2F6XLV1 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Crocc2F6XLV1 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Crocc2F6XLV1 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Crocc2F6XLV1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Crocc2F6XLV1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Crocc2F6XLV1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms