Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Taf4E9QAP7 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf4E9QAP7 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms