Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

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Length 1,021 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzd7E9Q9W7 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzd7E9Q9W7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzd7E9Q9W7 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzd7E9Q9W7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzd7E9Q9W7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzd7E9Q9W7 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzd7E9Q9W7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzd7E9Q9W7 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzd7E9Q9W7 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzd7E9Q9W7 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzd7E9Q9W7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzd7E9Q9W7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzd7E9Q9W7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzd7E9Q9W7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzd7E9Q9W7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzd7E9Q9W7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzd7E9Q9W7 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzd7E9Q9W7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzd7E9Q9W7 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzd7E9Q9W7 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzd7E9Q9W7 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Pdzd7E9Q9W7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Pdzd7E9Q9W7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Pdzd7E9Q9W7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Pdzd7E9Q9W7 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzd7E9Q9W7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzd7E9Q9W7 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzd7E9Q9W7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzd7E9Q9W7 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzd7E9Q9W7 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzd7E9Q9W7 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Pdzd7E9Q9W7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzd7E9Q9W7 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzd7E9Q9W7 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzd7E9Q9W7 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzd7E9Q9W7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Pdzd7E9Q9W7 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzd7E9Q9W7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzd7E9Q9W7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Pdzd7E9Q9W7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Pdzd7E9Q9W7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Pdzd7E9Q9W7 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzd7E9Q9W7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzd7E9Q9W7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzd7E9Q9W7 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzd7E9Q9W7 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzd7E9Q9W7 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzd7E9Q9W7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzd7E9Q9W7 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzd7E9Q9W7 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzd7E9Q9W7 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzd7E9Q9W7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzd7E9Q9W7 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzd7E9Q9W7 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzd7E9Q9W7 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzd7E9Q9W7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzd7E9Q9W7 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Pdzd7E9Q9W7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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