Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms