Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Pdzd2E9Q1M1 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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