Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms