Protein–RNA interactions for Protein: E9PWP9

4931408C20Rik, RIKEN cDNA 4931408C20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931408C20RikE9PWP9 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931408C20RikE9PWP9 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931408C20RikE9PWP9 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931408C20RikE9PWP9 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931408C20RikE9PWP9 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931408C20RikE9PWP9 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
4931408C20RikE9PWP9 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
4931408C20RikE9PWP9 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931408C20RikE9PWP9 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
4931408C20RikE9PWP9 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931408C20RikE9PWP9 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931408C20RikE9PWP9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931408C20RikE9PWP9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931408C20RikE9PWP9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931408C20RikE9PWP9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931408C20RikE9PWP9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931408C20RikE9PWP9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931408C20RikE9PWP9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931408C20RikE9PWP9 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931408C20RikE9PWP9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931408C20RikE9PWP9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931408C20RikE9PWP9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931408C20RikE9PWP9 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931408C20RikE9PWP9 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
4931408C20RikE9PWP9 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931408C20RikE9PWP9 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931408C20RikE9PWP9 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
4931408C20RikE9PWP9 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
4931408C20RikE9PWP9 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931408C20RikE9PWP9 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
4931408C20RikE9PWP9 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
4931408C20RikE9PWP9 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
4931408C20RikE9PWP9 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
4931408C20RikE9PWP9 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
4931408C20RikE9PWP9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
4931408C20RikE9PWP9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931408C20RikE9PWP9 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms