Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc175E9PVB3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc175E9PVB3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc175E9PVB3 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc175E9PVB3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc175E9PVB3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms