Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms