Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc170D3YXL0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms